临床医学系现有临床医学和口腔医学两个专业。临床医学专业为河南省特色专业建设点，高校“专业综合改革”试点，获得河南省卓越医生教育培养计划建设项目、河南省创新行动计划骨干专业建设项目。教学设施完善、实验设备先进。临床医学实训基地为河南省示范性实训基地、全科医师培养基地。
临床医学专业
培养目标：本专业培养基础理论扎实、操作技能较高，具有高尚的职业道德，良好的医患沟通能力及团结协作精神，能适应医疗卫生工作的高素质应用型专门人才。
主干课程：人体解剖学、生理学、生物化学、病原生物及免疫学、病理学、药理学、预防医学、诊断学、内科学、外科学、儿科学、妇产科学、全科医学概要。
就业方向：适合在医疗卫生单位从事医疗、保健、预防、康复等方面的工作。
口腔医学专业
培养目标：本专业培养具有必备的医学基础理论知识，掌握口腔医学的基础理论并具有扎实的临床操作技能，能熟练从事口腔常见病、多发病的诊治、修复和预防工作的高素质技能型专门人才。
主干课程：人体解剖学、生理学、口腔解剖生理学、口腔组织病理学、诊断学、口腔内科学、口腔预防学、口腔修复学、口腔颌面外科学、口腔正畸学、口腔材料学。
就业方向：适合在医疗卫生单位从事口腔医疗、保健工作，在医学美容机构从事面部整容、美容等方面工作；也可到牙科医疗器械公司、牙膏公司、牙科材料公司等从事营销工作。
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